Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd4Q8BFT6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Jmjd4Q8BFT6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms