Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfascQ810U3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfascQ810U3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms