Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Liat1Q810M6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Liat1Q810M6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms