Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ChfrQ810L3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms