Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim19Q80ZU4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim19Q80ZU4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms