Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8Q80YR6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms