Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3cQ80U95 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube3cQ80U95 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube3cQ80U95 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3cQ80U95 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3cQ80U95 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms