Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pja2Q80U04 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pja2Q80U04 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms