Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpap1Q80TE0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rpap1Q80TE0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpap1Q80TE0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms