Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nek5Q7TSC3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek5Q7TSC3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek5Q7TSC3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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