Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms