Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actn1Q7TPR4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms