Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms