Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS8

Epop, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpopQ7TNS8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpopQ7TNS8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms