Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpf1Q7TND5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms