Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms