Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chsy1Q6ZQ11 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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