Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms