Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf316Q6PGE4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf316Q6PGE4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms