Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf1Q6PDM2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf1Q6PDM2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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