Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM1

Msl1, Male-specific lethal 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl1Q6PDM1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msl1Q6PDM1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msl1Q6PDM1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms