Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl2Q6PA06 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms