Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp4r3aQ6P2K6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms