Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrimpolQ6P1E7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms