Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms