Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rprd2Q6NXI6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms