Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx11Q6AXC6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx11Q6AXC6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms