Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PnkdQ69ZP3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PnkdQ69ZP3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PnkdQ69ZP3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PnkdQ69ZP3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PnkdQ69ZP3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PnkdQ69ZP3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PnkdQ69ZP3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PnkdQ69ZP3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PnkdQ69ZP3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PnkdQ69ZP3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PnkdQ69ZP3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PnkdQ69ZP3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PnkdQ69ZP3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms