Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk13Q69ZA1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms