Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn4Q69Z26 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms