Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms