Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q66JV7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q66JV7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q66JV7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q66JV7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q66JV7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q66JV7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q66JV7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q66JV7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q66JV7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q66JV7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q66JV7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q66JV7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q66JV7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q66JV7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Q66JV7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Q66JV7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Q66JV7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q66JV7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q66JV7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q66JV7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q66JV7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q66JV7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q66JV7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q66JV7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q66JV7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q66JV7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q66JV7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q66JV7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q66JV7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q66JV7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q66JV7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q66JV7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q66JV7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q66JV7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q66JV7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q66JV7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q66JV7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q66JV7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q66JV7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q66JV7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q66JV7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q66JV7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q66JV7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q66JV7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q66JV7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q66JV7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q66JV7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q66JV7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q66JV7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q66JV7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q66JV7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q66JV7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q66JV7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q66JV7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Q66JV7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q66JV7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q66JV7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q66JV7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q66JV7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q66JV7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q66JV7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q66JV7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q66JV7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q66JV7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q66JV7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q66JV7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q66JV7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q66JV7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q66JV7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q66JV7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms