Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
VclQ64727 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VclQ64727 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VclQ64727 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VclQ64727 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VclQ64727 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VclQ64727 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VclQ64727 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VclQ64727 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VclQ64727 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VclQ64727 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VclQ64727 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VclQ64727 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VclQ64727 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VclQ64727 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VclQ64727 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VclQ64727 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VclQ64727 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VclQ64727 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VclQ64727 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VclQ64727 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VclQ64727 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VclQ64727 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VclQ64727 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VclQ64727 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VclQ64727 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VclQ64727 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VclQ64727 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VclQ64727 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VclQ64727 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VclQ64727 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VclQ64727 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VclQ64727 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VclQ64727 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VclQ64727 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VclQ64727 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VclQ64727 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VclQ64727 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VclQ64727 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VclQ64727 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VclQ64727 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VclQ64727 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms