Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2bQ64511 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Top2bQ64511 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms