Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms