Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn1Q64347 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms