Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt12Q64291 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt12Q64291 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt12Q64291 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt12Q64291 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt12Q64291 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt12Q64291 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt12Q64291 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt12Q64291 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt12Q64291 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt12Q64291 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt12Q64291 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt12Q64291 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms