Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim24Q64127 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim24Q64127 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms