Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift52Q62559 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ift52Q62559 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ift52Q62559 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ift52Q62559 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ift52Q62559 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift52Q62559 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift52Q62559 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift52Q62559 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift52Q62559 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms