Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms