Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa13Q62424 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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