Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SypQ62277 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SypQ62277 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SypQ62277 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SypQ62277 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SypQ62277 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SypQ62277 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SypQ62277 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SypQ62277 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SypQ62277 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SypQ62277 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SypQ62277 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SypQ62277 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SypQ62277 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SypQ62277 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SypQ62277 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SypQ62277 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SypQ62277 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SypQ62277 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SypQ62277 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SypQ62277 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SypQ62277 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SypQ62277 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms