Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Kdm5dQ62240 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Kdm5dQ62240 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Kdm5dQ62240 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms