Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms