Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbm38Q62176 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rbm38Q62176 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rbm38Q62176 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Rbm38Q62176 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Rbm38Q62176 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Rbm38Q62176 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rbm38Q62176 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rbm38Q62176 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rbm38Q62176 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rbm38Q62176 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rbm38Q62176 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rbm38Q62176 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rbm38Q62176 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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