Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms