Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ctr9Q62018 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctr9Q62018 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms