Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Odf1Q61999 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Odf1Q61999 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Odf1Q61999 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Odf1Q61999 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Odf1Q61999 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Odf1Q61999 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Odf1Q61999 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Odf1Q61999 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Odf1Q61999 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Odf1Q61999 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Odf1Q61999 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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