Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms