Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AtrxQ61687 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms